Bakterie są organizmami prokariotycznymi czyli bezjądrowymi. Większość z nich to osobniki jednokomórkowe. Nie posiadają struktur obłonionych, więc nie ma u nich podziału na kompartmenty co uniemożliwia przeprowadzanie sprzecznych reakcji. Nie posiadają one chloroplastów (wyjątkiem są np. sinice które posiadają tylakoidy i przeprowadzają fotosyntezę), przez co bakterie są cudzożywne. Materiał genetyczny (genofor zlokalizowany w nukleoidzie) jest u nich kolisty i nienawinięty na białka histonowe co odróżnia je od komórek eukariotycznych. Bakterie rozmnażają się bezpłciowo.
