Fotosynteza przebiega oczywiście w chloroplastach.
Barwnikami fotosyntetycznymi jest chlorofil, lub jego odmiana bakteriochlorofil występujący u bakterii.
Różnica między nimi dotyczy rodzaju i ilości barwników absorpcyjnych, stąd inne są ich właściwości i udział w fazie jasnej fotosyntezy.